讲述了以全国高中生麻将大会冠军为目标的清澄高中麻将部以及咲在麻将竞技比赛中激烈夺冠的故事。

故事背景设定在《天才麻将少女》本篇第二主角原村和曾生活的奈良县，主角校为阿知贺女子学院。 原村和在初中阶段曾经在阿知贺女子学院读书，由于人数不足，麻将部一度处于废部的境地，而麻将部的活动室则被当做当地儿童麻将活动室，今年由于人数足够，麻将部重新开始活动，围绕原村和展开的麻将竞技故事由此开始。

女主角爱蜜莉雅与精灵帕克相遇，被召唤至罗兹瓦尔宅邸之前的故事。描写一直生活在艾利欧鲁大森林的爱蜜莉雅面临露格尼卡王国王选之前的故事，TV系列的前日谭。

昴等人打倒了诅咒的元凶——魔兽沃尔加姆，拯救了阿拉姆村的孩子们。终于到来的安稳并未持续很久，昴就瞒着所有人前去挑战某个极秘任务。但尽管昴做了变装，也很快就被以佩特拉为首的村里的孩子们识破了真实身份。开始后5秒就曝光的这一任务，是事前调查和爱蜜莉雅约会的路线。

走出便利店要回家的高中生‧菜月昴突然被召唤到异世界。这莫非就是很流行的异世界召唤？可是眼前没有召唤者就算了，还遭遇强盗迅速面临性命危机。这时，一名神秘银发美少女和猫精灵拯救了一筹莫展的他。以报恩为名义，昴自告奋勇要帮助少女找东西。然而，好不容易才掌握到线索，昴和少女却被不明人士攻击而殒命──本来应该是这样，但回过神来，…

菜月昂是一位平凡的十七岁高中男生，某日，离开便利店准备回家的他突然被召唤到了异世界。人生地不熟的菜月昂很快就遇到了麻烦，在此危急时刻，名为爱蜜莉雅的神秘少女带着灵猫帕克出现在了菜月昂的面前，成为了他的救星，为了报答少女的恩情，菜月昂和她结伴而行。让两人没有想到的是，他们竟然遭到了攻击不幸丧命，当菜月昂再度睁开双眼时，却…

在从便利商店回家的路上，突然被异世界召唤的少年菜月昴。在无法依靠任何东西的异世界，无力的少年手唯一的力量……那是“死去然后重新开始”的力量。为了守护最重要的人们，为了取回确实存在着又无可替代的时间，少年抗拒着绝望，勇敢地面对着残酷的命运。

“我与骑士提欧的圣印立下契约，并宣誓永远的忠诚”孤高魔法师希露卡与流浪骑士提欧。两人交换的主从之誓，会为混沌与战乱的大陆带来变革之风吗？混沌支配了一切的大陆，阿托拉丹。人们因混沌所产生的灾害而胆怯，并被拥有镇压混沌之力“圣印”的君主所守护着。但，不知何时起君主们舍弃了“守护人们”这一理念，开始了互相争夺圣印和领土的战乱…

结城友奈每天早上起床、做好准备出门上学、上课、参加社团活动、和朋友一起玩……她就是这样每天过着普通日常的中学2年生。

未来的日本秋叶原，往昔流行的御宅文化已经式微，就连曾经的地标性圣地也不为人们所知晓，售卖二次元商品的店铺很多都因为生意不好而关门玩家们将扮演一家二次元商店的老板，为了经营好店铺，也为了将御宅文化传承下去，不断地努力。